Berdasarkan visi dan misi Fakultas Perikanan dan Kelautan Universitas Riau, maka ditetapkan tujuan strategis FPK UNRI, yaitu:
Berdasarkan analisis SWOT yang telah dilakukan, maka ditetapkan sasaran strategis FPK UNRI yang juga diselaraskan dengan sasaran strategis UNRI. Sasaran strategi FPK UNRI yaitu :